Le SDEC Energie est administré par un comité syndical composé des délégués des collectivités adhérentes.
 
Le comité se réunit trois fois par an pour administrer le SDEC Energie et débattre des orientations.
 
Les membres actuels du comité syndical ont été élus par les conseillers municipaux des communes isolées et par les comités syndicaux de base.
 
Chaque commune isolée ou syndicat de base désigne, en plus de son ou ses délégués titulaires, un ou des délégués suppléants en nombre égal à celui des délégués titulaires. Les suppléants sont appelés à siéger au comité en cas d’absence du délégué titulaire.
 
Les membres du comité prennent part au vote pour les affaires présentant un intérêt commun à tous les adhérents et, notamment, pour l’adoption du règlement intérieur, les votes des budgets et l’approbation du compte administratif.